Flux RSS biochimej Superposition des structures de 2 protéines

Les protéines doivent avoir des structures relativement proches. L'onglet "Structure similarity" d'une entrée de la PDB affiche la liste des protéines de structures similaires. Exemple : 2NBT

Spécifier la région que l'on désire superposer.

  • Exemples : 1JOY et 5B1O => région 229 - 286 / 4FVY et 6NGM => région 1 - 422
  • Contre-exemple (structures différentes) : 1BTA et 4D7J => région 5 - 65
    • Code PDB de la structure de réference (exemples : ubiquitine 1UBQ / bungarotoxine 1KBA)

    Code PDB de la structure à superposer (exemples : ubiquitine 1D3Z / bungarotoxine 2NBT)

    Position du premier acide aminé de la région à superposer

    Position du dernier acide aminé de la région à superposer

    [L'interrogation de la base de données Protein Data bank peut prendre un peu de temps.]