Seul le substrat subit un changement conformationnel, la structure de l'enzyme étant considérée comme "rigide" (figure ci-dessous).

Le résultat est un accroissement de la labilité des liaisons à rompre dans la molécule de substrat puisque celui-ci, bien que fixé de manière lâche, subit des tensions dans ses liaisons qui l'amènent dans une configuration proche de celle de l'état de transition.

Source : "Enzyme Kinetics" I. Segel (1975), Ed. J. Wiley & Sons, Inc.