Equilibre de fixation d'un ligand sur une protéine - Représentation de Scatchard
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L'équilibre de fixation d'un ligand sur une protéine correspond à la réaction :

Equilibre fixation proteine ligand binding equilibrium biochimej

  • Vitesse d'association : va ka . [P] . [L]
  • Vitesse de dissociation : vd kd . [PL]

ka et kd sont des constantes microscopiques.

Avec : [L] = concentration du ligand libre et [PL] = concentration du ligand lié.

A l'équilibre, les vitesses sont égales :

Equilibre fixation proteine ligand binding equilibrium biochimej

Avec : Ka = constante d'équilibre d'association et Kd = constante d'équilibre de dissociation. Ce sont des constantes macroscopiques.

Et :

           1
Ka = -----
           Kd

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Relation de Scatchard pour un site de fixation : n = 1

[P]totale = [P] + [PL]

representation Scatchard nombre moyen site fixation ligand binding equilibrium biochimej

representation Scatchard nombre moyen site fixation ligand binding equilibrium biochimej

Effet de la valeur de Kd sur l'allure des courbes de saturation : A : Kd = 0,5 nM; B : Kd = 2 nM ; C : Kd = 10 nM; D : Kd = 100 nM.

La relation de Scatchard est généralisable à :

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La fonction de saturation

fonction de saturation biochimej = nombre moyen de sites de fixation occupés par le ligand ramené au nombre total de sites de fixation = f([L])

          Concentration du ligand lié
fonction de saturation biochimej    =    --------------------------------------
              Concentration totale de sites de fixation

   Concentration des complexes [PLi]
fonction de saturation biochimej= --------------------------------------------------------------------------------------
     [nombre n de site(s) de fixation par molécule de protéine] x [concentration totale de protéine]

fonction saturation representation Scatchard nombre moyen site fixation ligand binding equilibrium biochimej

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Représentation de SCATCHARD

representation Scatchard nombre moyen site fixation ligand binding equilibrium biochimej

representation Scatchard nombre moyen site fixation ligand binding equilibrium biochimej

Cas de n sites identiques et NON indépendants : fixation coopérative et allostérie

  • Représentation de Scatchard
  • Représentation et coefficient de Hill
===> Voir la fixation de l'oxygène sur l'hémoglobine

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