L'aldolase est une enzyme de la voie de la glycolyse (voir la partie glycolyse - fermentation)

• les aldolases des mammifères et des végétaux supérieurs contiennent 2 acides aminés essentiels pour le mécanisme : une lysine et une cystéine
• chez le lapin, c'est un tétramère de masse molaire = 160.000 Da
• les aldolases des micro-organismes suivent un autre mécanisme qui met en jeu un cation métallique 

La réaction catalysée par l'aldolase est :

fructose 1,6 diP <=> G3P + DHAP
         6 C           <=>  3 C  +  3 C

Le mécanisme catalytique est détaillé dans la figure ci-dessous.

Comme les réactions ne sont pas totales, à l'équilibre on a :

• fructose 1,6 diP marqué sur le C₁ (voir la partie glycolyse - fermentation)
• G3P non marqué
• DHAP marquée sur le C₁