Etude d'une protéine à régulation allostérique : l'hémoglobine |
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La fixation réversible de l'oxygène sur l'hème de l'hémoglobine peut être décrite de la manière suivante : déoxyhémoglobine + 4 O2 <=> oxyhémoglobine L'hémoglobine peut aussi fixer réversiblement le CO2, les ions H+ et Cl- et le 2-3 biphosphoglycérate (BPG). Par la suite, on utilisera les appellations suivantes :
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A. Etude de la fixation du BPG sur la déoxyhémoglobine Cette fixation est étudiée par la technique de la dialyse à l'équilibre. On utilise 6 cellules de dialyse, constituées de deux compartiments A et B, de même volume (500 µL), séparés par une membrane semi-perméable. Au temps t = 0 de l'expérience, on introduit:
Les cellules de dialyse sont placées à 4°C et agitées doucement jusqu'à ce que l'équilibre de dialyse soit atteint. On récupère alors le contenu de chacun des deux compartiments des 6 cellules et on compte la radioactivité. Les valeurs sont les suivantes : |
cellule de dialyse | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 |
radioactivité compartiment A (dpm) | 4050 | 6830 | 14025 | 29120 | 61000 | 158400 |
radioactivité compartiment B (dpm) | 5870 | 9650 | 19025 | 36860 | 71800 | 172050 |
1. Décrire cette expérience. Que contiennent les compartiments A et B, respectivement au temps t = 0 et à l'équilibre de dialyse ? Comment s'assurer que cet équilibre est atteint ? 2. Tracer la courbe : [BPGlié]/[Hb]0 = f([BPGlibre]). A quel phénomène l'allure de cette courbe vous fait-elle penser ? 3. En utilisant la représentation de Scatchard : ν/[BPGlibre] = f([BPGlié]) avec ν = [BPGlié]/[Hb]0 , déterminer le nombre de site(s) de fixation du BPG sur l'Hb et la valeur de la constante de dissociation KD. 4. Interprétez ces résultats d'un point de vue physiologique. |
B. Etude de la fixation de l'oxygène sur l'hémoglobine Les figures ci-dessous représentent :
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1. Expliquez la procédure utlisée pour obtenir un tel spectre. Quelle est la longueur d'onde qui reflète le changement de conformation induit par l'oxygénation de l'hémoglobine ? A quoi est dû ce changement de conformation ? 2. A 560 nm, ε est le coefficient d'extinction molaire de l'Hb et ε' celui de l'Hb(O2)4. Calculez la différence entre ces deux coefficients, Δε560, sachant que l = 1 cm. Pour toutes les expériences, la concentration totale d'hémoglobine dans chaque cuve est 6 10-5 M. |
3. On étudie le mécanisme de fixation de l'oxygène sur l'Hb par cette technique, dans deux conditions: l'expérience 1 et l'expérience 2 sont réalisées respectivement en absence et en présence de BPG.
Les résultats de l'expérience 1 sont les suivants : |
pO2 (mm Hg) | 0,25 | 0,4 | 0,65 | 1 | 1,6 | 2,2 | 2,5 | 2,8 | 3,2 |
- ΔA560 | 0,003 | 0,004 | 0,007 | 0,014 | 0,032 | 0,057 | 0,078 | 0,100 | 0,120 |
pO2 (mm Hg) | 3,8 | 4 | 5 | 6,3 | 10 | 16 | 25 | 40 | 50 |
- ΔA560 | 0,140 | 0,160 | 0,180 | 0,210 | 0,222 | 0,228 | 0,231 | 0,232 | 0,232 |
Les résultats de l'expérience 2 sont les suivants : |
pO2 (mm Hg) | 3,5 | 5 | 6,5 | 7,5 | 8,5 | 9,5 | 11 | 13,6 | 16 | 18,5 | 50 |
- ΔA560 | 0,023 | 0,047 | 0,076 | 0,097 | 0,127 | 0,137 | 0,164 | 0,190 | 0,207 | 0,221 | 0,232 |
3a. Pourquoi les valeurs de différence d'absorption à 560 nm sont-elles affectées d'un signe négatif ? 3b. Tracez les courbes: -ΔA560 = f(pO2) et commentez leur allure. 3c. On définit : Y = fraction d'hémoglobine oxygénée à une pression pO2 quelconque = [O2]lié/(n . [Hb]0) avec n = 4 sites de fixation de l'oxygène. Tracez les courbes: Y = f(pO2) pour les expériences 1 et 2. 3d. Déterminez pour ces deux expériences le pourcentage d'oxygène fixé à l'hémoglobine qui est libéré quand la pression d'oxygène passe de pO2 = 50 mm Hg (pression partielle au niveau des poumons) à pO2 = 5 mm Hg (pression partielle au niveau des muscles). Quelle précision quant au rôle physiologique du BPG ces résultats mettent-ils en évidence ? |
C. Représentation et coefficient de Hill et représentation de Scatchard 1. Pour rendre compte de l'allure sigmoïdale des courbes de saturation, Archibald Hill a proposé en 1910 une relation empirique qui, dans le cas de l'Hb, s'écrit : [pO2]nH nH est le coefficient de Hill ou indice de coopérativité. nH est différent du nombre de site de fixation du ligand.
2. On appelle le nombre moyen de molécules d'oxygène fixées par molécule d'Hb.
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