Etude d'une protéine à régulation allostérique : l'hémoglobine |
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La fixation réversible de l'oxygène sur l'hème de l'hémoglobine peut être décrite de la manière suivante : déoxyhémoglobine + 4 O2 <=> oxyhémoglobine L'hémoglobine peut aussi fixer réversiblement le CO2, les ions H+ et Cl- et le 2-3 biphosphoglycérate (BPG). Par la suite, on utilisera les appellations suivantes :
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A. Etude de la fixation du BPG sur la déoxyhémoglobine Cette fixation est étudiée par la technique de la dialyse à l'équilibre. On utilise 6 cellules de dialyse, constituées de deux compartiments A et B, de même volume (500 µL), séparés par une membrane semi-perméable. Au temps t = 0 de l'expérience, on introduit:
Les cellules de dialyse sont placées à 4°C et agitées doucement jusqu'à ce que l'équilibre de dialyse soit atteint. On récupère alors le contenu de chacun des deux compartiments des 6 cellules et on compte la radioactivité. Les valeurs sont les suivantes : |
cellule de dialyse | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 |
radioactivité compartiment A (dpm) | 4050 | 6830 | 14025 | 29120 | 61000 | 158400 |
radioactivité compartiment B (dpm) | 5870 | 9650 | 19025 | 36860 | 71800 | 172050 |
1. Décrire cette expérience. Que contiennent les compartiments A et B, respectivement au temps t = 0 et à l'équilibre de dialyse ? Comment s'assurer que cet équilibre est atteint ? 2. Tracer la courbe : [BPGlié]/[Hb]0 = f([BPGlibre]). A quel phénomène l'allure de cette courbe vous fait-elle penser ? 3. En utilisant la représentation de Scatchard : ν/[BPGlibre] = f([BPGlié]) avec ν = [BPGlié]/[Hb]0 , déterminer le nombre de site(s) de fixation du BPG sur l'Hb et la valeur de la constante de dissociation KD. 4. Interprétez ces résultats d'un point de vue physiologique. |
B. Etude de la fixation de l'oxygène sur l'hémoglobine Les figures ci-dessous représentent :
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1. Expliquez la procédure utlisée pour obtenir un tel spectre. Quelle est la longueur d'onde qui reflète le changement de conformation induit par l'oxygénation de l'hémoglobine ? A quoi est dû ce changement de conformation ? 2. A 560 nm, ε est le coefficient d'extinction molaire de l'Hb et ε' celui de l'Hb(O2)4. Calculez la différence entre ces deux coefficients, Δε560, sachant que l = 1 cm. Pour toutes les expériences, la concentration totale d'hémoglobine dans chaque cuve est 6 10-5 M. |
3. On étudie le mécanisme de fixation de l'oxygène sur l'Hb par cette technique, dans deux conditions: l'expérience 1 et l'expérience 2 sont réalisées respectivement en absence et en présence de BPG.
Les résultats de l'expérience 1 sont les suivants : |
pO2 (mm Hg) | 0,25 | 0,4 | 0,65 | 1 | 1,6 | 2,2 | 2,5 | 2,8 | 3,2 |
- ΔA560 | 0,003 | 0,004 | 0,007 | 0,014 | 0,032 | 0,057 | 0,078 | 0,100 | 0,120 |
pO2 (mm Hg) | 3,8 | 4 | 5 | 6,3 | 10 | 16 | 25 | 40 | 50 |
- ΔA560 | 0,140 | 0,160 | 0,180 | 0,210 | 0,222 | 0,228 | 0,231 | 0,232 | 0,232 |
Les résultats de l'expérience 2 sont les suivants : |
pO2 (mm Hg) | 3,5 | 5 | 6,5 | 7,5 | 8,5 | 9,5 | 11 | 13,6 | 16 | 18,5 | 50 |
- ΔA560 | 0,023 | 0,047 | 0,076 | 0,097 | 0,127 | 0,137 | 0,164 | 0,190 | 0,207 | 0,221 | 0,232 |
3a. Pourquoi les valeurs de différence d'absorption à 560 nm sont-elles affectées d'un signe négatif ? 3b. Tracez les courbes: -ΔA560 = f(pO2) et commentez leur allure. 3c. On définit : Y = fraction d'hémoglobine oxygénée à une pression pO2 quelconque = [O2]lié/(n . [Hb]0) avec n = 4 sites de fixation de l'oxygène. Tracez les courbes: Y = f(pO2) pour les expériences 1 et 2. 3d. Déterminez pour ces deux expériences le pourcentage d'oxygène fixé à l'hémoglobine qui est libéré quand la pression d'oxygène passe de pO2 = 50 mm Hg (pression partielle au niveau des poumons) à pO2 = 5 mm Hg (pression partielle au niveau des muscles). Quelle précision quant au rôle physiologique du BPG ces résultats mettent-ils en évidence ? |
C. Représentation et coefficient de Hill et représentation de Scatchard 1. Pour rendre compte de l'allure sigmoïdale des courbes de saturation, Archibald Hill a proposé en 1910 une relation empirique qui, dans le cas de l'Hb, s'écrit : [pO2]nH nH est le coefficient de Hill ou indice de coopérativité. nH est différent du nombre de site de fixation du ligand.
2. On appelle
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