Interprétation de représentations de Scatchard
Voir le cours sur les interactions protéine-ligand.

La fixation d'une hormone (H) sur un récepteur (R) est étudiée chez des patients ("abnormal binding"). En parallèle, la fixation est étudiée chez un sujet normal ("normal binding").

equilibre fixation ligand hormone recepteur scatchard plot protein ligand equilibrium association constant biochimej

Interpréter les représentations de Scatchard en terme de nombre de site(s) de liaison et d'affinité par rapport au sujet normal.
Combien de sites minimum de fixation contient le récepteur d'un sujet "normal" ?


Voir un cours sur les récepteurs.

On compare le nombre de molécules d'hormones fixées pour chaque type de site de fixation et la constante d'association (l'affinité) de l'hormone pour ces sites, entre le récepteur "normal" et les 5 récepteurs "patients" (figures a à e).

hormone recepteur equilibre fixation ligand hormone recepteur scatchard plot protein ligand equilibrium association constant biochimej

  • Qu'il s'agisse du récepteur "normal" ou du récepteur "patient", on constate que les sites sont identiques puisqu'il n'y a qu'une droite, donc une seule pente qui reflète l'affinité.
  • Le point d'intersection avec l'axe des abcisses indique le nombre de site(s).

Les droites du récepteur "normal" des figures a à e sont évidemment les mêmes.

Figure comparaison nombre de site "patient" vs. "normal" comparaison affinité site "patient" vs. "normal"
a supérieur (3 vs. 2) identique (même pente)
b inférieur (1 vs. 2) identique (même pente)
c identique (2 vs. 2) plus forte (pente plus forte pour "patient")
d identique (2 vs. 2) moins forte (pente plus faible pour "patient")
e inférieur (1 vs. 2) plus forte (pente plus forte pour "patient")

La différence entre les point d'intersection avec l'axe des abcisses des droites de la figure a est forcément égale à au moins 1 site (structuralement, il ne peut exister des "portions" de site de fixation).

On peut donc supposer qu'il y a au moins 2 sites de fixation sur le récepteur "normal".

site equilibre fixation ligand hormone recepteur scatchard plot protein ligand equilibrium association constant biochimej

Voir un développement sur les équilibres de fixation d'un ligand sur une protéine.

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