Interactions protéine - protéine et interactomique - Extinction de fluorescence |
Voir le cours sur les interactions protéine-ligand. |
1. Définir les phénomènes de fluorescence et d'extinction de fluorescence ou "quenching". L'extinction de fluorescence ("fluorescence quenching") diminue le rendement de l'émission de fluorescence. Ce processus correspond à la réaction physico-chimique : Mf*+D -> M+D |
2. Le tableau suivant indique le rapport des rendements de fluorescence d'un fluorophore en absence (f0) ou en présence (f[Q]) d'un désactivateur à la concentration [Q]. Calculer la constante de vitesse de désactivation kq avec une durée de vie de l'état excité du fluorophore τ0 = 10-14 s. |
[Q] (mM) | f0/f[Q] | f0/f[Q] - 1 |
0 | 1 | 0 |
0,4 | 1,06 | 0,06 |
0,8 | 1,12 | 0,12 |
1,5 | 1,22 | 0,22 |
2,8 | 1,42 | 0,42 |
3,9 | 1,59 | 0,59 |
4,7 | 1,71 | 0,71 |
5,5 | 1,83 | 0,83 |
La cinétique de désactivation suit l'équation de Stern - Volmer : La représentation f0/f[Q] - 1 = f([Q]) est donc une droite de pente KSV.
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Les valeurs du tableau permettent de déterminer la pente de la droite : KSV = 151,3 M-1 Donc : kq = KSV / τ0 = 151,3 M-1 / 10-14 s = 1,51 1016 M-1.s-1 kq est une constante de vitesse microscopique du second ordre (réaction bimoléculaire Mf*+D). |
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