Sur les 27 résidus sérine que contient la chymotrypsine, seul le résidu sérine 195 du site actif est assez nucléophile pour attaquer le groupe fluorophosphate du di-isopropyl fluorophosphate (DFP).

Il se forme une liaison covalente (phosphoester) qui rend cette inhibition irréversible.

Le mécanisme réactionnel est le suivant :

Remarque : la fixation de l'inactivateur n'est pas un équilibre.

Voir un cours sur l'inhibition des réactions enzymatiques.