Exercice n°1 (2 points)

A1. Une valeur d'énergie libre de Gibbs standard nulle signifie que la réaction considérée est à l'équilibre. FAUX
A2. Une réaction d'oxydo-réduction impliquant le couple (2H+/H2) se déroule dans le même sens à pH 1 et à pH 14. FAUX
A3. L'hypothèse du quasi-équilibre stipule que : k-1 << kcat. FAUX
A4. Le potentiel d'oxydo-réduction standard du couple (2H+/H2) est plus élevé à pH = 0 que dans la cellule. FAUX

Exercice n°2 (8 points)

Q1. Ecrire le schéma réactionnel du système suivant :

  • Mécanisme au hasard (substrats A et B).
  • Un inhibiteur I est non compétitif de A.
  • Un inhibiteur I est compétitif de B.

enzymology two substrate kinetics cinetique enzymatique deux substrat ordered random hasard biochimej

Q2. Calculez la variation d’énergie libre de Gibbs standard dans les conditions physiologiques (ΔG°’) associée à la réoxydation du NAD réduit par l’oxygène moléculaire.

ΔG°réoxydation = - 2 . F . ΔE°’

=  - 2 x 96500 x [0,82 - (-0,32)]

= - 220 kJ.mol-1

Q3. Calculez le nombre théorique de molécules d'ATP susceptibles d'être synthétisées avec la VEL Gibbs calculée ci-dessus (question  Q2).

n = 220 kJ.mol-1 / 30 kJ.mol-1 = 7

Q4. L’oxydation d’un couple rédox (Oox / Ored) est couplée à la réduction d’un couple rédox (Rox / Rred), avec échange de 3 électrons.

Ecrire les 2 demi réactions rédox.

Ored <==> Oox + 3 e-

Rox + 3 e- <==> Rred

Q5. Calculer ΔG°’couplage de la réaction globale précédente (question Q4).

ΔG0'couplage = - n . F . ΔE0'

=  - 3 x 96500 x 0,01 = - 2,9 kJ.mol-1

Exercice n°3 (10 points)

Paramètres ADP PAPS

VM (unités arbitraires)

0,13 0,13

VM (ÁM.min-1)

81,2

81,2

kcat (s-1)

38,7

38,7

-1/KD (mM-1)

- 1,8 0

KD (mM)

0,56 non déterminable
-1/KM (µM-1) (- 1,8 mM-1) - 0,125
KM (ÁM) (0,56 mM) 8
enzymology two substrate kinetics cinetique enzymatique deux substrat biochimej

Analyse du PAPS :

enzymology two substrate kinetics cinetique enzymatique deux substrat biochimej
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Schéma catalytique complet.

Séquentiel ordonné avec ADP = premier substrat.

L’iso-PAPS se fixe sur l’enzyme ayant déjà fixé l’ADP (inhibition incompétitive).

enzymology two substrate kinetics cinetique enzymatique deux substrat ordered random hasard biochimej

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