Exercice n°1 (2 points)

A1. Une valeur d'énergie libre de Gibbs standard nulle signifie que la réaction considérée est à l'équilibre. FAUX
A2. Une réaction d'oxydo-réduction impliquant le couple (2H+/H2) se déroule dans le même sens à pH 1 et à pH 14. FAUX
A3. L'hypothèse du quasi-équilibre stipule que : k-1 << kcat. FAUX
A4. Le potentiel d'oxydo-réduction standard du couple (2H+/H2) est plus élevé à pH = 0 que dans la cellule. VRAI

Exercice n°2 (8 points)

Q1. Ecrire le schéma réactionnel du système suivant :

  • Mécanisme au hasard (substrats A et B).
  • Un inhibiteur I est non compétitif de A.
  • Un inhibiteur I est compétitif de B.

enzymology two substrate kinetics cinetique enzymatique deux substrat ordered random hasard biochimej

Q2. Calculez la variation d’énergie libre de Gibbs standard dans les conditions physiologiques (ΔG°’) associée à la réoxydation du NAD réduit par l’oxygène moléculaire.

ΔG°réoxydation = - 2 . F . ΔE°’

=  - 2 x 96500 x [0,82 - (-0,32)]

= - 220 kJ.mol-1

Q3. Calculez le nombre théorique de molécules d'ATP susceptibles d'être synthétisées avec la VEL Gibbs calculée ci-dessus (question  Q2).

n = 220 kJ.mol-1 / 30 kJ.mol-1 = 7

Q4. L’oxydation d’un couple rédox (Oox / Ored) est couplée à la réduction d’un couple rédox (Rox / Rred), avec échange de 3 électrons.

Ecrire les 2 demi réactions rédox.

Ored <==> Oox + 3 e-

Rox + 3 e- <==> Rred

Q5. Calculer ΔG°’couplage de la réaction globale précédente (question Q4).

ΔG0'couplage = - n . F . ΔE0'

=  - 3 x 96500 x 0,01 = - 2,9 kJ.mol-1

Exercice n°3 (10 points)

Paramètres ADP PAPS

VM (unités arbitraires)

0,13 0,13

VM (µM.min-1)

81,2

81,2

kcat (s-1)

38,7

38,7

-1/KD (mM-1)

- 1,8 0

KD (mM)

0,56 non déterminable
-1/KM (µM-1) (- 1,8 mM-1) - 0,125
KM (µM) (0,56 mM) 8
enzymology two substrate kinetics cinetique enzymatique deux substrat biochimej

Analyse du PAPS

enzymology two substrate kinetics cinetique enzymatique deux substrat biochimej

Analyse du PAPS

enzymology two substrate kinetics cinetique enzymatique deux substrat biochimej

Schéma catalytique complet

Séquentiel ordonné avec ADP = premier substrat.

L’iso-PAPS se fixe sur l’enzyme ayant déjà fixé l’ADP (inhibition incompétitive).

enzymology two substrate kinetics cinetique enzymatique deux substrat ordered random hasard biochimej

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