Exercice n°1 (3 points)

A1. ΔG°’réaction sens A --> B = -3,27 kJ.mol-1, alors ΔG°’réaction sens B --> A = 3,27 kJ.mol-1. VRAI
A2. ΔG’réaction sens A --> B = -3,27 kJ.mol-1, alors ΔG’réaction sens B --> A = 3,27 kJ.mol-1. VRAI

A3. KM est une concentration.

VRAI

A4. L'hypothèse du quasi-équilibre stipule que : k-1 >> kcat.

VRAI

A5. Le transport actif primaire utilise de l'énergie pour transporter un soluté dans le sens de son gradient de concentration.

FAUX

A6. Un transporteur qui assure la diffusion facilitée est saturable.

VRAI

Exercice n°2 (1 point)

Ecrire le schéma réactionnel du système suivant :

  • mécanisme ordonné à 2 substrats (X et Y) et X est le 1er substrat
  • I est un inhibiteur incompétitif de X

enzymology two substrate kinetics cinetique enzymatique deux substrat ordered random hasard ping pong mechanism biochimej

Exercice n°3 (8 points). Répondre de manière claire et simple par quelques mots-clés.

Considérons la figure ci-contre.

Source : Yano et al. (2014) Biochemistry 53, 1179 - 1190

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Q1. A quel(s) type(s) de mécanisme(s) à 2 substrats correspondent respectivement les mécanismes A et B ?

mécanisme A : ping-pong un site

mécanisme B : ping-pong deux sites

Q2. Dans quel grand processus biologique cette enzyme intervient-elle ?

Transfert des électrons -  phosphorylation oxydative

Q3. Que signifie « Q » dans ces schémas ?

Quinone (coenzyme Q)

Q4. Mécanisme A : « both NADH oxidation and quinone reduction occur on the same face of the isoalloxazine ring. Consequently, the binding of each substrate is mutually exclusive because of the overlap between binding sites ».

Quel type d’inhibition les substrats exercent-ils les uns sur les autres ?

Ce chevauchement permet une inhibition compétitive :

  • entre les substrats
  • entre chaque produit de la réaction et le substrat de l'autre demi-réaction

Q5. Soit la réaction : A + 2 B <==> 3 C. Ecrire l’expression de la constante d’équilibre.

Keq = [C]3 / [A] x [B]2

Q6. Calculer la valeur de cette constante d’équilibre (question Q5) sachant que ΔG°’ = -5 kJ.mol-1.
T = 37°C ; R = 8,31 J.K-1.mol-1

Keq = 6,97

Q7. Sachant que le substrat d’une enzyme est HMG-CoA, quel type d’inhibiteur est la lovastatine ?

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Compétitif

Q8. Pourquoi ?

Analogue structural

Exercice n°4 (8 points)

Graphes primaires

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Graphes secondaires

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Résumé des paramètres cinétiques

Paramètres ATP-Mg2- Créatine

1/VM (µmoles-1.min.mg)

0,005 0,005

VM (µmoles.min-1.mg-1)

200

200

-1/KD (mM-1)

- 1,1 - 0,038

KD (mM)

0,9 26,3
-1/KM (mM-1) - 8 - 0,27
KM (mM) 0,125 3,7

Schéma catalytique complet.

Le point de concourance des droites des graphes primaires se situe au dessus de l'axe des abcisses. Celà indique une fixation dépendante des substrats.

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