Correction Exercice N°5 : Force proton motrice - synthèse d'ATP
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Schéma général du fonctionnement de la chaîne respiratoire :

metabolisme chaine respiratoire gradient electrochimique force proton motrice oxydo reduction ATP synthase biochimej

  • transfert des électrons
  • consommation d'oxygène (complexe IV)
  • expulsion des protons vers l'espace intermembranaire (force proton motrice)
  • synthèse d'ATP avec retour de 3 protons vers la matrice (dissipation du gradient)

metabolisme chaine respiratoire gradient electrochimique force proton motrice oxydo reduction ATP synthase biochimej

Source : KEGG

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5a. Calcul de la variation de l'énergie libre de Gibbs standard de la réoxydation du NADH

Les deux-demi réactions rédox sont :

  • NADH + H+ <=> NAD+ + 2 H+ + 2 e-
  • 1/2 O2 + 2 H+ + 2 e- <=> H2O

Avec :

  • E°'(NAD+/NADH) = - 0,32 V
  • E°'(O2/H2O) = + 0,82 V

La réaction globale est : NADH + H+ + 1/2 O2 <=> NAD+ + H2O

Caractérisée par une différence de potentiel rédox standard :

ΔE°' = E°'(O2/H2O) - E°'(NAD+/NADH) = 0,82 - (- 0,32) = + 1,14 V

D'après la relation : ΔG°'(réoxydation) = - n . F . ΔE°'

on obtient : ΔG°'(réoxydation)  = - 2 x 96500 x 1,14 = - 216 kJ.mol-1

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5b. Calcul de la variation d'énergie libre de Gibbs associée à l'expulsion d'un proton

La variation d'énergie libre du transfert de protons s'écrit :

ΔG'(H+) = RT Ln ([H+]ext / [H+]int) + (zH+ . F . ΔΨ)

Comme : pH = - log([H+]) et Ln(a) = 2,3 . log10a

=> ΔG'(H+) = 2,3 . RT (pHint- pHext) + (zH+ . F . ΔΨ)

avec :

  • (pHint- pHext) = - (- 1,4) = 1,4 unités pH
  • zH+ = +1
  • ΔΨ = 140 mV = 0,14 V

=> ΔG'(H+) = (2,3 x 8,31 x 310 x 1,4) + (1 x 96500 x 0,14)

soit : ΔG'(H+)  =  + 21,8 kJ.(mol H+ explulsé)-1

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5c. Nombre maximum théorique de protons expulsés lors de la réoxydation d'une mole de NADH,H+

Ce nombre théorique est donné par le rapport : nH+  =  |ΔG°'(réoxydation)| / |ΔG'(H+)|

Soit environ 10 protons expulsés.(mol NADH réoxydée)-1

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5d. Nombre minimal de protons qui doivent rentrer pour permettre la synthèse d'une mole d'ATP.

La synthèse de l'ATP s'écrit : ADP + Pi  <=>  ATP + H2O

K'φ est la constante définie par le rapport des concentrations physiologiques des métabolites : K'φ = [ATP]φ / ([ADP]φ . [Pi]φ)

La concentration de l'eau (55,5 M) est considérée comme une constante.

Comme : [ATP]φ = [ADP]φ = [Pi]φ = 10-2 M

alors : K'φ = 102 M-1

donc :
ΔG'(synthèse ATP) =  ΔG°'(synthèse ATP) + RT . Ln (K'φ)
ΔG'(synthèse ATP) = (30,6) + (8,31 x 310 x Ln 102)

soit : ΔG'(synthèse ATP) = + 42 kJ.mol-1

Le nombre minimal de protons qui doivent rentrer est donc : mH+ =  |ΔG'(synthèse ATP)| / |ΔG'(H+)| = 2 protons

  • Cependant, 3 protons sont nécessaires à l'ATP synthase pour synthétiser une molécules d'ATP.

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