Bioénergétique : réactions d'oxydo-réduction, chaîne respiratoire et force proton motrice |
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Exercice N°1
1. Plus un couple rédox a un potentiel de réduction standard bas, plus il a tendance à céder ses électrons. Ecrivez les 2 demi-réactions rédox correspondant à chacune des réactions globales (couplées) ci-dessous, de sorte que chaque réaction globale soit écrite dans le sens thermodynamiquement spontané. (1) pyruvate + β-hydroxybutyrate
<=> lactate + acétoacétate
Remarques : (2 H+ + 2 e-) sont échangés dans la réaction (1) ; la réaction (3) n’est pas équilibrée. 2. Calculez la variation d’énergie libre de Gibbs standard dans les conditions physiologiques (ΔG°') de la réaction (4) considérée dans le sens spontané. 3. Précisez la voie métabolique dans laquelle se situe la réaction considérée. Données : Exercice N°2 1. Calculez, à 25°C, la valeur du potentiel de réduction standard dans les conditions physiologiques (pH = 7) du couple rédox (2H+ / H2). Donnée : Le couple rédox de référence est alors le couple (2H+ / H2) à pH = 0 ([H3O+] = 1 M), dont le potentiel de réduction = 0, par définition. 2. Sachant que : E°' (NAD+ / NADH) = - 0,32 V, expliquez le choix de pH = 7 comme condition standard de pH, pour la détermination des potentiels de réduction standard des couples rédox qui existent dans une cellule. Exercice N°3 Soit la réaction de réduction
de l'acétaldéhyde en éthanol, catalysée
par l'alcool déshydrogénase : 1. Ecrivez les 2 demi-réactions rédox correspondant à cette réaction globale. 2. Calculez, à 25°C, la variation d'énergie libre de Gibbs standard physiologique de la réaction considérée dans le sens spontané. 3. Calculez la valeur de la constante d'équilibre. Donnée : E°' (acétaldéhyde / éthanol) = - 0,163 V Exercice N°4 On considère la réaction globale suivante et sa variation d'énergie libre standard de Gibbs dans les conditions physiologiques : 1/2 O2 + H2 <=> H2O ΔG°'= - 57,19 kcal.mol-1 1. Ecrivez (en les équilibrant) les 2 demi-réactions rédox, sachant que le couple (H+ / 1/2 H2) est le couple réducteur. 2. Calculez le potentiel d'oxydo-réduction standard dans les conditions physiologiques du couple (1/2 O2 / H2O). Données : T = 37°C ; E°' (2H+ / H2) = - 0,42 V Exercice N°5 Première partie Les réactions de dégradation des biomolécules et/ou les réactions d'oxydo-réduction conduisent à la formation de CO2 mais aussi de protons et/ou d'électrons qui vont réduire les coenzymes NAD+ et FAD impliqués dans les voies métaboliques. Calculez le nombre théorique de molécules d'ATP susceptibles d'être synthétisées lors de la réoxydation d’une molécule de NAD réduit (NADH + H+). Donnée : E°’ (1/2 O2/ H2O) = + 0,82 V Seconde partie L'oxydation du NADH,H+ aux dépends de l'oxygène moléculaire par l'intermédiaire de la chaîne respiratoire est accompagnée de l'expulsion de protons. Quand un transfert de matière d'un compartiment biologique à un autre s'accompagne d'un transfert de charges, chaque mole de charges placées dans un potentiel Ψ a une énergie électrique : E = z . N . e . Ψ = z . F . Ψ La variation d'énergie libre globale de ce transfert est alors : ΔG' = RT Ln ([H+]ext/[H+]int) + z . F . ΔΨ Au niveau des mitochondries, l'expulsion de protons conduit à une différence :
Enfin, la synthèse d'ATP par l'intermédiaire de l'ATPase membranaire est couplée au retour de protons de l'extérieur de la mitochondrie vers l'intérieur. 1. Calculez la variation d'énergie libre standard de la réoxydation du NADH. Données : T = 37°C; E°'(NAD+ / NADH) = - 0,32 V; F = 96500 C.mol-1; [ATP] = [ADP] = [Pi] = 10 mM Exercice N°6 Au cours de la respiration, une bactérie utilise PO43- comme accepteur d'électrons et NADH comme donneur. Cette réaction d'oxydo-réduction a un rendement de 60%. 1. Calculez le nombre de moles d'ATP qui peut être synthétisé par paire d'électrons. Données : E°' (PO43- / HPO42-) = + 0,48 V et E°' (1/2 O2/ H2O) = + 0,82 V Exercice N°71. L'alcool déshydrogénase catalyse la réaction : isopropanol + NAD+ <=> acétone + NADH + H+ La constante d'équilibre de la réaction à 25°C est 7,19 10-9 M. Calculer la variation d'énergie libre standard de cette réaction. 2. La variation d'énergie libre standard de la réaction : isopropanol (aq) <=> acétone (aq) + H2 (gaz) est ΔG°' = + 24,6 kJ/mole. Calculez la variation d'énergie libre standard de la réaction d'hydrogénation du NAD+. |