Question n°1 (4 points) Répondre par vrai ou faux aux assertions suivantes.
A1. L’ubiquitinylation est une modification post-traductionnelle. | VRAI |
A2. L’ATP est un effecteur hétérotrope de la PFK-1. | VRAI |
A3. La dissociation de la calmoduline de la CaM-kinase II l'inactive complètement. | FAUX |
A4. Une lysine conservée empêche la fixation du NADP+ sur les déshydrogénases à NAD+. | FAUX |
A5. Ce sont les 8 acides aminés en amont du site phospho-accepteur qui influencent la sélection du substrat par les protéines kinases. | FAUX |
A6. L’épinéphrine accélère la dégradation du glycogène. | VRAI |
A7. La fixation du calcium sur la calmoduline est coopérative. | VRAI |
A8. L’augmentation de la concentration du glucagon augmente l’activité kinase de la PFK-2. | FAUX |
Question n°2 (12 points) Donner une réponse courte et simple aux questions suivantes.
Q1. Citer 2 précurseurs de la néoglucogénèse. | Acides aminés dits "néoglucogènes" / lactate / glycérol / pyruvate |
Q2. Citer une base de données dédiée à l’annotation des gènes. | Gene Ontology (GO) |
Q3. Par quel type d’enzyme la dégradation de l'AMPc est-elle catalysée ? | 3',5'-nucleotide cyclique phosphodiesterase |
Q4. Métabolisme du glycogène : quelles sont les 2 enzymes respectivement inactivée et activée par la protéine kinase A AMPc dépendante ? | Inactive la glycogène synthase - Active la phosphorylase kinase |
Q5. Citer un motif structural du domaine de liaison à l'ADN des récepteurs nucléaires. | 9 cystéines conservées / structure "en doigt de zinc" de type C4 (4 cystéines) |
Q6. Comment la charge énergétique adénylique de la cellule doit-elle être pour que la glycolyse soit ralentie ? |
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Q7. Quelle est la localisation cellulaire de la glucose-6-phosphatase ? Dans quelle voie cette enzyme intervient-elle ? |
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Q8. Quelle grandeur traduit la réversibilité ou l’irréversibilité d’une réaction au sein d’une voie métabolique ? | Variation d’énergie libre de Gibbs |
Q9. Dans quelle modification post-traductionnelle intervient la S-adénosylmethionine ? | Méthylation |
Question n°3 (4 points)
Un métabolite M1 est transformé en M2 via la réaction R1. M2 est transformé en M1 via la réaction R2 et en M3 via la réaction R3. M3 est transformé en M4 via la réaction R4. Enfin M4 est transformé en M1 via la réaction R5.
a. Faire le schéma (cadre ci-dessous) de l’ensemble des réactions de ce système.
R1 R3 R4 R5 |
b. Remplir la matrice de stoechiomètrie S (ci-dessous) qui y est associée.
R1 | R2 | R3 | R4 | R5 | |
M1 | -1 | +1 | 0 | 0 | +1 |
M2 | +1 | -1 | -1 | 0 | 0 |
M3 | 0 | 0 | +1 | -1 | 0 |
M4 | 0 | 0 | 0 | +1 | -1 |