Question n°1 (4 points) Répondre par vrai ou faux aux assertions suivantes.

A1. L’ubiquitinylation est une modification post-traductionnelle. VRAI
A2. L’ATP est un effecteur hétérotrope de la PFK-1. VRAI
A3. La dissociation de la calmoduline de la CaM-kinase II l'inactive complètement. FAUX
A4. Une lysine conservée empêche la fixation du NADP+ sur les déshydrogénases à NAD+. FAUX
A5. Ce sont les 8 acides aminés en amont du site phospho-accepteur qui influencent la sélection du substrat par les protéines kinases. FAUX
A6. L’épinéphrine accélère la dégradation du glycogène. VRAI
A7. La fixation du calcium sur la calmoduline est coopérative. VRAI
A8. L’augmentation de la concentration du glucagon augmente l’activité kinase de la PFK-2. FAUX

Question n°2 (12 points) Donner une réponse courte et simple aux questions suivantes.

Q1. Citer 2 précurseurs de la néoglucogénèse. Acides aminés dits "néoglucogènes" / lactate / glycérol / pyruvate
Q2. Citer une base de données dédiée à l’annotation des gènes. Gene Ontology (GO)
Q3. Par quel type d’enzyme la dégradation de l'AMPc est-elle catalysée  ? 3',5'-nucleotide cyclique phosphodiesterase
Q4. Métabolisme du glycogène : quelles sont les 2 enzymes respectivement inactivée et activée par la protéine kinase A AMPc dépendante  ? Inactive la glycogène synthase - Active la phosphorylase kinase
Q5. Citer un motif structural du domaine de liaison à l'ADN des récepteurs nucléaires. 9 cystéines conservées / structure "en doigt de zinc" de type C4 (4 cystéines)

Q6. Comment la charge énergétique adénylique de la cellule doit-elle être pour que la glycolyse soit ralentie ?

Elevée

Q7. Quelle est la localisation cellulaire de la glucose-6-phosphatase ?

Dans quelle voie cette enzyme intervient-elle ?

Réticulum endoplasmique

Néoglucogénèse

Q8. Quelle grandeur traduit la réversibilité ou l’irréversibilité d’une réaction au sein d’une voie métabolique ? Variation d’énergie libre de Gibbs
Q9. Dans quelle modification post-traductionnelle intervient la S-adénosylmethionine ? Méthylation
 

Question n°3 (4 points)

Un métabolite M1 est transformé en M2 via la réaction R1. M2 est transformé en M1 via la réaction R2 et en M3 via la réaction R3. M3 est transformé en M4 via la réaction R4. Enfin M4 est transformé en M1 via la réaction R5.

a. Faire le schéma (cadre ci-dessous) de l’ensemble des réactions de ce système.

              R1                  R3                   R4                   R5
M1 <======> M2 ---------> M3 ---------> M4 ---------> M1
              R2

b. Remplir la matrice de stoechiomètrie S (ci-dessous) qui y est associée.

  R1 R2 R3 R4 R5
M1 -1 +1 0 0 +1
M2 +1 -1 -1 0 0
M3 0 0 +1 -1 0
M4 0 0 0 +1 -1


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