Question n°1 (2,5 points) Répondre par vrai ou faux aux assertions suivantes.
| A1. Toutes les protéines sont complètement repliées. | FAUX |
| A2. Une réaction est caractérisée par ΔG°' >> 0. Il est donc certain que cette réaction ne peut pas avoir lieu dans la cellule. | FAUX |
| A3. Le glucose-6 phosphate entre et sort librement de la cellule hépatique. | FAUX |
| A4. L’AMPK active les voies métaboliques qui produisent de l’ATP. | VRAI |
| A5. Quand le taux de calcium augmente, le motif de la calmoduline qui fixe le calcium est phosphorylé. | FAUX |
| A6. Certains récepteurs couplés à une protéine G contiennent un petit domaine N-terminal de liaison à l’ADN. | FAUX |
| A7. Le récepteur de l’insuline est un récepteur à activitétyrosine kinase. | VRAI |
| A8. La phosphorylation modifie la localisation sub-cellulaire de certains facteurs de transcription. | VRAI |
| A9. L’AMPK est la protéine kinase dépendante de l’AMP cyclique. | FAUX |
| A10. Le glucagon contrôle la fusion des vésicules de stockage du transporteur GLUT4 avec la membrane plasmique des cellules musculaires. | FAUX |
Question n°2 (7,5 points) Donner une réponse courte et simple aux questions suivantes.
| Q1. Quelle molécule est intrinsèquement liée à la fois au catabolisme et à l’anabolisme ? | ATP |
Q2. Comment s’appelle une protéine ou un domaine d’une protéine non replié ? |
Nativement non structuré |
Q3. Citer un type de protéine de signalisation qui, comme la calmoduline, se fixent sur un très grand nombre de cibles. |
Protéine 14.3.3 |
| Q4. Citer une base de donnée de structures de protéines. | Protein Data Bank |
Q5. Quelle enzyme clé établit un lien entre glycolyse et néoglucogénèse ? Quel métabolite clé établit un lien entre glycolyse et néoglucogénèse? |
PFK2 - F2,6BPase F2,6BP |
Q6. Citer une protéine sérine / thréonine kinase. |
Protéine kinase A (PKA) / protéine kinase G / protéine kinase C (PKC) / MAP kinase / CDPK / CaM kinase |
Q7. Une réaction est caractérisée par Keq = 1. Que vaut ΔG°' de cette réaction ? |
0 |
Q8. Quelle enzyme synthétise l’AMPc ? Quelle enzyme convertit l’AMPc en AMP ? |
Phosphodiestérase |
Q9. Quelle enzyme de la glycogénolyse, la protéine kinase A AMPc dépendante active-t-elle ? Quelle hormone peptidique a le même effet activateur ? |
Phosphorylase kinase Glucagon |
Q10. Citer 2 mots ou expressions clés liés à la régulation du métabolisme (autres que régulation, métabolisme, hormone, facteur de transcription). |
Allostérie / tyrosine kinases / transduction signal / messagers 2ndaires / protéine G / Calmoduline / … |
Q11. Séquence 1 : DEVALVDV - Séquence 2 : RKLIALRI. De ces 2 séquences, quelle est la plus probable pour un motif de fixation du NAD+ ? Quel est l’acide aminé clé ? |
Séquence 1 D |
Question n°3 (5,5 points) Remplissez les 6 cases vides du schéma suivant.
| Dans la voie de l’acide arachidonique (non représentée dans cette figure), quelle enzyme le calcium co-active-t-il avec des MAP kinases p38 ? | phospholipases A2 : cPLA2 |
| Que signifie DAG ? | Diacylglycérol |
| Quel est le compartiment X ? | Réticulum endoplasmique |
Citer une protéine de signalisation ubiquitaire dont la fonction est liée à la concentration du calcium. Comment s’appelle le motif de fixation du calcium de cette protéine de signalisation ubiquitaire ? |
Calmoduline EF-Hand |
Question n°4 (4,5 points)
Soit la matrice de stœchiométrie S associée aux réactions globales (1), (2) et (3).
| R1 | R2 | R3 | R4 | R5 | |
| Fructose 6P | 0 | 1 | -1 | -1 | 0 |
| ATP | -1 | 0 | 0 | -1 | 0 |
| ADP | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| Fructose 1,6BP | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
| Glucose 6P | 1 | -1 | 1 | 0 | 0 |
| Glucose | -1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
Ecrivez les réactions globales (1), (2) et (3) en indiquant R1 à R5.
R1 R2 |
| Pourquoi la réaction (3) est-elle irréversible ? | ΔG°' < 0 |
Citer un inhibiteur allostérique de l’enzyme qui catalyse la réaction (3) ? |
ATP |
Comment s’appelle l’enzyme de la néoglucogenèse qui catalyse la réaction réverse de la réaction (3) ? |
Fructose-1,6-bisphosphatase |
