La biophysique - analyse des macromolécules biologiques

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1. Définition de la biophysique et rappel sur la structure des protéines

2. Quelques brefs rappels de physique

3. Les techniques spectroscopiques

3a. La spectroscopie ultraviolet / visible et la spectroscopie infrarouge

3b. La fluorescence

3c. Le dichroïsme circulaire

4. La résonance magnétique nucléaire (RMN)

5. La cristallographie ou diffraction des rayons X

6. La spectrométrie de masse

7. Application de la spectrométrie de masse à la protéomique

8. La résonance paramagnétique électronique (RPE)

9. La chromatographie liquide à haute performance

10. La mécanique et la modélisation moléculaires

11. Liens Internet

 

1. Définition de la biophysique et rappel sur la structure des protéines

Discipline qui analyse les phénomènes biologiques (biomécanique, imagerie médicale, fonction des organes, ...) et la structure des macromolécules biologiques à l'aide de théories et de techniques de la physique (voire de la chimie).

Ce cours focalise sur certaines méthodes biophysiques employées pour l'analyse de la structure des protéines.

Il existe quatre niveaux de structure des protéines (voir les structures) :

  • la structure primaire : c'est la séquence en acides aminés ou enchaînement polypeptidique (voir les cours "La bioinformatique")
  • les structures secondaires : c'est l'ensemble des structures locales spécifiques qu'adoptent certaines parties d'une protéine. C'est une étape du repliement des protéines
  • la structure tertiaire ou structure tridimensionnelle : parm