Question n°1 (4 points) : Répondre par vrai ou faux aux assertions suivantes.

A1. Quand la concentration du glucagon diminue, la glycolyse est ralentie. FAUX
A2. La concentration des métabolites n’a pas d’incidence sur la régulation du métabolisme. FAUX
A3. La sous-unité γ des protéines G possède une activité phosphatase. FAUX
A4. La glycogène synthase est activée par phosphorylation. FAUX
A5. Les processus de signalisation participent à la régulation du métabolisme. VRAI
A6. L’adrénaline ralentit la dégradation du glycogène. FAUX
A7. GLUT5 transporte spécifiquement le fructose. VRAI
A8. Le pli Rossmann fixe le NAD+ mais pas le NADP+. FAUX
A9. La séquence QWFIVGRET est fortement homologue à la séquence NYYVLGKDS. VRAI
A10. Le motif [DN]-x-D-G-[DN]-G-[QTY]-x(4)-E est un site de fixation d’un cation. VRAI
A11. La structure des transporteurs du glucose possède un grand nombre d’hélices car ils sont transmembranaires. VRAI
A12. Les sous-unité β et γ des protéines G se séparent avant de transduire le signal. FAUX
A13. La sous-unité γ des protéines G ne possède pas d’activité phosphatase. VRAI
A14. Environ 30% du protéome est phosphorylé. VRAI
A15. La glucokinase est inhibée par le glucose 6-phosphate. FAUX
A16. Le motif « EF-hand » a un caractère chargé et polaire. VRAI

Question n°2 (5 points) : Donner une réponse courte et simple (mots-clé) aux questions suivantes.

Q1. Quelle est la première cible d’une CaM-kinase II ? Elle-même
Q2. Citer une modification co-traductionnelle des protéines. Glycosylation - acétylation - isoprénylation
Q3. Citer une modification chimique majeure de l’ADN qui régule la transcription des gènes. Méthylation - Epigénétique
Q4. Citez une base de données généraliste mondiale spécialisée dans l’ontologie.

Gene Ontology (GO)
QuickGO (EBI)

Q5. Quel est l’élément structural clé de toute chaine polypeptidique repliée ? Le domaine

Question n°3 (11 points) : Lire le texte suivant puis donner des réponses courtes et simples (mots-clé).

The word fat has an almost universally negative connotation in modern society, whether as a pejorative term for describing someone who is overweight or as a foodstuff reviled for its deleterious impact on health. Obesity is associated with elevated levels of multiple kinds of fat, and fat accumulation in tissues is thought to contribute to the development of the unholy trinity of disorders that characterize type 2 diabetes: failure to respond to the glucose-regulating hormone insulin; failure to control glucose production by the liver; and failure of pancreatic β-cells, which store and release insulin.

Now, however, Yore et al. report in Cell that certain modified fatty acids are found at low, rather than elevated, levels in obese, insulin-resistant humans and mice. Furthermore, they show that administering these fatty acids to such mice improves glucose uptake from the blood, enhances insulin secretion and relieves obesity-associated inflammation, suggesting that these naturally occurring fats could be used for diabetes therapy.

Fatty acids and closely related glycerolipid molecules wear multiple biological hats, serving as a major energy reservoir, as constituents of cell membranes and as mediators of intracellular signalling. Yore and colleagues' report adds to emerging evidence implicating specific, low-abundance fatty acids as hormone-like 'lipokine' molecules involved in metabolic regulation.

The same research group had previously shown that elimination of the glucose-transport protein GLUT-4 from adipose (fat-storing) tissue resulted in insulin resistance in liver and muscle — a condition in which cells of these organs have an impaired capacity to increase glucose uptake in response to insulin, contributing to the abnormally high blood-glucose levels that define diabetes.

By contrast, adipose-specific overexpression of GLUT-4 caused higher glucose uptake than in control mice - making the mice more sensitive to insulin despite also increasing fat synthesis and levels of circulating fatty acids.

Muoio & Newgard (2014) "Diabetes : the good in fat" Nature 516, 49 - 50

insuline diabete GLUT FAHFA fatty acid glyceride

The lipid-generating impact of GLUT-4 overexpression was predictable, given that fat cells (adipocytes) use glucose for fat synthesis. But surprisingly, the enhanced glucose uptake was eliminated by adipose-specific deletion of the transcription factor ChREBP, which regulates fat synthesis, suggesting that the glucose-uptake effect depended on lipogenesis. This finding led Yore and colleagues to the hypothesis that certain fatty acids have positive effects on glucose regulation.

The authors used mass spectrometry to compare the lipid content of the blood serum and adipose tissue taken from these 'diabetes-resistant' mice to that of normal mice. They identified five lipids that were significantly elevated in the modified mice, four of which were made up of a typical long-chain fatty acid (palmitate, oleate, stearate or palmitoleate) joined by an ester bond to a hydroxylated version of one of the same set of fatty acids. The authors refer to these compounds, which had not been described previously, as fatty-acid esters of hydroxyl fatty acids (FAHFAs).

A quelle(s) catégorie(s) les molécules  découvertes appartiennent-elles ? Fatty-Acid esters of Hydroxyl Fatty Acids (FAHFAs)
Par quelle technique les ont-ils découvertes ?

Spectrométrie de masse

Quels sont les 3 effets majeurs de ces molécules ? sensitizing cells to insulin
stimulating insulin production
reducing inflammation
Citez 3 molécules clé issues de cet article sans reprendre vos réponses quant aux 3 effets majeurs (question ci-dessus). GLUT-4
glucose
ChREBP
Dans quel journal scientifique les résultats ont-ils été publiés ?

Cell

Ce journal est-il très prestigieux, peu prestigieux ou tout à fait confidentiel ?

L’un des plus prestigieux

Qu’est  ChREBP ?

Facteur de transcription

De quelle molécule clé ChREBP  régule-t-il l’activation ?

Glucose-responsive transcription factor
Régulation de la transcription du gène codant la pyruvate kinase
Régulation de la transcription du gène codant FAS ("Fatty Acid Synthase")
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