Bioinformatique
- Cours
- Applications - travaux dirigés
- 1. La bioinformatique : définition, description, démarche et principales étapes
- 2. Quelques domaines en omique
- 3. Propriétés des acides aminés et matrices de substitution
- 4. Complément sur les ponts disulfure
- 5. Le stockage de la bioinformation : les bases de données biologiques
- 6. Quelques formats de fichiers dans les bases de données biologiques
- 7. Algorithmes et programmes de comparaison de séquences
- 8. Les matrices de substitution
- 9. Les expressions régulières et principe de BLAST
- 10. Les méthodes de séquençage
- 11. Le séquençage du génome humain
- 12. Quelques éléments de thérapie génique
- 13. Les puces à ADN
- 14. Protéomique : notions théoriques
- 15. Métabolomique & modèle de recontruction métabolique
- 16. Annotation et ontologie
- 17. Bioinformatique structurale
- 18. Mécanique et de modélisation moléculaires
- 19. Apprentissage profond : traitement du langage appliqué aux protéines
- 1. Recherche de fichiers GenPept (Entrez - NCBI) - affinement de la requête
- 2. Etude des protéines LEA ("Late Embryogenesis Abundant proteins")
- 3. Analyse des sites d'hydrolyse des peptides signaux
- 4. Recherche et analyse de séquences de toxines
- 5. Etude protéomique de la RuBisCO
- 6. Relation structure - fonction de la glutamate déshydrogénase
- 7. Déshydrogénase / Calmoduline / Récepteur insuline
- 8. Recherche et analyse des séquences des 3 isoformes de glutamate déshydrogénase
- 9. Eléments de langage Python appliqué aux séquences biologiques
- 10. Phylogénie (globines, insuline)
- Divers
- Recherche
