COURS
Biochimie Structurale
et Métabolique
1. Variation d'énergie libre de Gibbs & Keq / ATP & couplage énergétique
2. Oxydo-réduction / NAD(P)+ / Chaîne respiratoire & Synthèse d'ATP
3. Les mécanismes de transports membranaires : passifs, actifs / pores, pompes, canaux
4. Cycle de l'azote - Métabolisme des acides aminés - Cycle de l'urée
5. La molécule d'eau et les liaisons dans les molécules biologiques
6. Les glucides
7. Carbohydrates
8. L'interférence ARN - RNAi
9. L'épissage des ARN messagers pré-matures : le spliceosome
10. Biochimie métabolique
11. Les membranes : structure des lipides membranaires et des protéines membranaires
12. Epigénétique - nucléosomes et régulation de la transcription
13. Les métabolites secondaires ou produits naturels - Le métabolisme secondaire
14. Les mécanismes CRISPR - Cas
15. Les ARN et le monde à ARN ("
RNA world
") - les ribozymes
16. Les virus et l'infection par les virus
17. Métabolisme mitochondrial lié à la chaîne respiratoire
Enzymologie
1. Historique / Site actif / Complexe enzyme-substrat / Etat de transition
2. L'équation de Henri-Michaelis-Menten / l'équation de Briggs-Haldane
3. Les inhibitions des réactions enzymatiques
4. Les cinétiques enzymatiques à deux substrats (hypothèse quasi - équilibre)
5. Effets de paramètres physico-chimiques sur l'activité enzymatique
6. Fixation d'un ligand sur une protéine & Allostérie
a. Démonstration de l'équation de SCATCHARD
b. N sites identiques et indépendants : représentation de SCATCHARD
c. Représentation de SCATCHARD : série d'exercice
d. N sites NON identiques et indépendants : équation de ADAIR
e. N sites identiques et NON indépendants : équation et représentation de HILL
f. N sites identiques et NON indépendants : modèle de MONOD, WYMAN & CHANGEUX
g. Application : Etude de l'hémoglobine
7. Application des enzymes dans l'industrie - Biochimie et enzymologie industrielle
8. Les protéases
9. Les protéines à plusieurs fonctions ou protéines "moonlighting"
10. Les pseudoenzymes : homologues catalytiquement inactifs d'enzymes
11. Les microprotéines ou micropeptides biologiquement actifs
12. Promiscuité enzymatique et évolution dirigée des enzymes
Ensemble
de cours
1. La relation structure - fonction des protéines
2. Régulation du métabolisme
3. La respiration et la mitochondrie
4. La photosynthèse et le chloroplaste
5. Génomique fonctionnelle, protéomique et métabolomique
6. Interactions protéine-protéine & interactomique
Cours
Généraux
1. La chromatographie liquide
2. La radioactivité
3. Construction de banques ADNc - phage lambda
4. La bioinformatique
5. La biophysique - analyse des macromolécules biologiques
6. Comparaison cellules Eucaryote, Procaryote et virus
7. Les organites des cellules Eucaryotes
8. Méthodes d'étude de la cellule et des macromolécules biologiques
9. Réponses des plantes aux stress abiotiques - rôles des LEAP et des HSP
10. "
Unfolded Protein Response
" - UPR
11. Application de l'intelligence artificielle et de l'apprentissage profond à quelques domaines de la biologie
12. Biogénèse (synthèse, adressage et assemblage) des protéines membranaires intégrales
Radioprotection
1. Rayonnements ionisants et radioactivité
2. Interaction rayonnements ionisants - matière
3. Protection contre les rayonnements ionisants
4. Effets biologiques des rayonnements ionisants
5. Législation et réglementation
6. La détection des rayonnements ionisants